El Departamento de Sistemas fue creado en octubre de 1983 después de la restructuración física y orgánica de la Universidad a raíz del terremoto ocurrido en la ciudad de Popayán, inició con cinco profesores quienes prestaban servicios a los programas de Contaduría, Derecho, Ingeniería Civil e Ingeniería Electrónica y Telecomunicaciones. Sus primeros profesores fueron los ingenieros Fernando Aristizábal Ossa, Henry Ceballos, Alfredo Ortiz Landázuri y Eduardo Rojas Pineda.
Es una unidad académica adscrita a la Facultad de Ingeniería Electrónica y Telecomunicaciones, que pretende aportar soluciones que beneficien a la comunidad en general; para esto, cultiva la enseñanza junto con la investigación y el desarrollo en Ciencias de la Computación e Ingeniería de Software, con un aporte social, mediante la realización de proyectos académicos e investigativos que beneficien a la región y al país.
Es una unidad académica adscrita a la Facultad de Ingeniería Electrónica y Telecomunicaciones, que pretende aportar soluciones que beneficien a la comunidad en general; para esto, cultiva la enseñanza junto con la investigación y el desarrollo en Ciencias de la Computación e Ingeniería de Software, con un aporte social, mediante la realización de proyectos académicos e investigativos que beneficien a la región y al país.